Органом управления епархией, согласно Устава Русской Православной Церкви, является Епархиальный совет. Председателем Епархиального совета является управляющий Великолукской епархией, епископ Великолукский и Невельский Сергий.
Состав Епархиального совета:
- протоиерей Стефан Вахрушев – заместитель председателя;
- протоиерей Петр Нетреба – секретарь;
- архимандрит Макарий (Швайко);
- протоиерей Иоанн Ильницкий;
- протоиерей Николай Ильницкий.
